政府颁布126项总统令
调整与各项业务相关的细则
公诉厅也可使用紧急车辆
拒绝配合重大犯罪调查厅采集指纹或受处罚
拘留场所适用范围扩大至“警察署等侦查机关”
明确公务员自愿提前退休津贴不予发放对象
随着检察厅被撤销，相关法规的调整不仅涉及侦查、起诉程序，还延伸至总统室监察、公务员人事管理及紧急车辆使用。政府颁布的126项总统令，将原由检察厅承担的多项职责分别划归公诉厅和重大犯罪调查厅。侦查职能移交重大犯罪调查厅，公诉及刑罚执行职责则由公诉厅承接，与各项业务相关的细则也相应作出调整。
总统秘书室监察组便是典型案例。修订后的机构编制规定，将检察厅从可派员参加监察组的机构名单中删除，同时加入公诉厅和重大犯罪调查厅，使总统室监察工作能够同时调用两家机构的人员。监察组负责收集高级公职人员、公共机构高管及总统亲属等涉嫌违法违纪的线索，并核实事实；如需侦查，则将案件交由或移送侦查机关。总统警卫工作的协作机制也将调整。总统警卫安全对策委员会原由大检察厅公共侦查政策官参加，今后将改由公诉厅公共安全部长和重大犯罪调查厅反腐败侦查局长参加。
公诉厅也可使用紧急车辆
公诉厅不仅负责起诉和支持公诉，还承担刑罚执行职责。这也是其虽无侦查权，却被纳入《道路交通法施行令》紧急车辆相关规定的原因。修订后的法令将“侦查机关”改为“侦查机关或公诉厅”，并在车辆使用目的中，除犯罪侦查外，明确加入提起公诉、支持公诉及刑罚执行。由于检察厅原有职责分由两家机构承担，车辆使用目的也作了相应区分，使公诉厅能够继续使用支持公诉或执行刑罚所需的紧急车辆。
公诉厅保留的案件处理职责也得到进一步明确。在维持由检察官职务代理分担较轻微案件处理工作的机制基础上，扩大了其可处理的案件范围。新增范围包括损失金额不超过1000万韩元的侵占脱离占有物、盗窃、诈骗及侵占案件，以及违反《汽车损害赔偿保障法》、客运及货运汽车运输事业相关法律、《建筑法》、《农水产品原产地标示法》、《停车场法》和《轻犯罪处罚法》等的案件。检察官职务代理制度，是由具备一定工作资历的刑事法务职公务员代行检察官部分职责的制度。通过刑事法务职五级公开竞争招聘考试后工作满5年，或在七级及以上岗位工作满10年的书记官、刑事法务事务官等，可担任这一职务。
重大犯罪调查厅调查员采集指纹的要求也纳入规定
负责侦查重大犯罪的重大犯罪调查厅，也出现在轻犯罪处罚规定中，涉及的是拒绝配合采集指纹的行为。《轻犯罪处罚法施行令》在“拒绝采集指纹”这一违法行为所涉及的执法人员范围中，加入了重大犯罪调查厅调查员。符合相关法定条件时，拒绝配合重大犯罪调查厅调查员采集指纹，也可能受到处罚。这并不意味着重大犯罪调查厅还负责侦查轻犯罪，而是因为重大犯罪侦查过程中同样需要核实嫌疑人身份。此次修订是在既有指纹采集规定中加入重大犯罪调查厅调查员，是否处罚仍须依据《轻犯罪处罚法》规定的条件判定。
条文调整背后，还有重大犯罪调查厅即将面临的现实问题。修订后的《刑罚执行法施行令》将“设于警察机关的拘留场所”改为“警察署等侦查机关的拘留场所”，扩大了适用范围。重大犯罪调查厅虽可逮捕、羁押嫌疑人，但其成立初期使用的多处办公楼并无自有拘留设施。总部和首尔分厅所在的首尔中区Rene Square大楼，将设置供嫌疑人在接受调查前后暂留的临时羁押室，而非拘留场所；部分地方分厅则将在临时办公楼启动工作。水原分厅在筹备成立过程中，也曾研究使用附近警察署拘留场所的方案。因此，即使重大犯罪调查厅正式挂牌，如何安置被捕嫌疑人，仍是需要借助现有警察及惩教设施解决的问题。
公务员自愿提前退休津贴规定则区分了侦查阶段与是否起诉的审查阶段。明确列入不予发放津贴范围的，不仅包括正在接受重大犯罪调查厅违法违纪侦查的人员，还包括案件已移交公诉厅、但尚未决定是否起诉的人员。这意味着，即使重大犯罪调查厅已结束侦查，只要公诉厅尚未作出决定，津贴发放限制就会继续。
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