SK바이오팜, AI 신약개발 특화 모델 구축…실제 연구 적용 추진

루닛 컨소시엄 참여, 신약개발 특화 모델 개발·검증
엔비디아 B200 기반 AI 인프라 활용

SK바이오팜 은 자사가 참여한 과학기술정보통신부 주관 '인공지능(AI) 특화 파운데이션 모델 프로젝트'가 약 10개월간의 개발 및 실증을 마무리했다고 6일 밝혔다.

SK바이오팜은 이번 프로젝트에서 데이터 구축부터 AI 모델 및 에이전트 개발, 신약개발 실증, 생태계 조성까지 전 과정에 참여했다. SK바이오팜을 비롯해 루닛, 트릴리온랩스, 아이젠사이언스, 카카오헬스케어 등 기업과 국내 산학·의료기관이 참여한 컨소시엄은 의과학 특화 인공지능 파운데이션 모델을 구축했다. 이를 기반으로 ▲신약개발(화합물·단백질) ▲의과학(오믹스) ▲임상 등 3개 영역의 특화 모델을 개발했다.

SK바이오팜 기업 로고 이미지. SK바이오팜

SK바이오팜은 프로젝트 초기부터 저분자 화합물, 단백질, 유전체 등 바이오 데이터 구축과 신약개발 특화 AI 모델 개발·검증에 참여했다. 제약 연구개발(R&D) 전문성과 실제 연구 현장의 요구를 반영해 약 714만건, 44억 토큰 규모의 신약개발 특화 학습 데이터를 구축했다. 이 데이터는 약물성·독성, 약물-표적 상호작용, 약물 반응성, 임상시험 결과 예측 등 66개 신약개발 과제를 포괄하며 모델 학습과 성능 검증에 활용됐다.

트릴리온랩스와 공동 개발한 신약개발 특화 모델의 성능 검증도 진행했다. 66개 과제를 벤치마크로 삼아 약물성, 독성, 약물-표적 상호작용, 약물 반응성, 임상시험 결과 예측 등 신약개발 분야별 예측 성능을 평가했다. 실제 제약사의 비공개 약물 데이터를 적용한 추가 검증도 진행해 공개 데이터뿐 아니라 실제 신약개발 과정에서 축적된 데이터를 활용할 수 있는지 확인했다.

실제 제약 R&D 업무와 임상개발 분야의 AI 활용 가능성도 탐색했다. 연구용 화학물질 관련 정보 추출부터 전문가 검토, 제출 서류 생성까지 지원하는 AI 업무지원 시스템을 구축했다. 알츠하이머병 공개 임상데이터를 활용한 디지털 트윈 모델을 통해 개별 환자의 향후 인지기능 변화를 예측하고, 새로운 방문 정보가 입력되면 예측 결과를 갱신하는 방식도 구현했다. 이를 바탕으로 환자 예후 분석과 임상시험 대상자 선별·설계 등에 AI를 활용할 가능성을 확인했다.

SK바이오팜은 이번 프로젝트에서 확보한 특화 파운데이션 모델 개발 역량과 최근 구축한 엔비디아 'B200' GPU 기반 AI 컴퓨팅 인프라를 바탕으로 'TR-AX'를 본격화할 계획이다. 특화 파운데이션 모델을 실제 연구과제에 적용해 질환·타깃·화합물 연구 역량을 고도화하고, 신약 후보물질 발굴부터 임상개발까지 AI 활용 범위를 확대해 연구개발 생산성과 실행력을 높인다는 방침이다.

이동훈 SK바이오팜 사장은 "신약개발 AI의 경쟁력은 결국 실제 연구 현장에서 얼마나 유의미한 답을 제시할 수 있느냐에 달려 있다"며 "이번 프로젝트를 통해 제약사의 데이터와 연구 전문성을 AI 모델에 직접 접목하고, 실제 신약개발 시나리오에서 그 가능성을 확인했다"고 말했다. 이어 "앞으로 자체 AI 인프라와 특화 모델 역량을 기반으로 TR-AX를 본격화해 AI가 연구원의 의사결정을 실질적으로 고도화하고, 신약개발의 속도와 성공 가능성을 높이는 핵심 경쟁력으로 발전시켜 나가겠다"고 덧붙였다.

박정연 기자 jy@asiae.co.kr